Nemunu galima plaukti irkliniais ir motoriniais laiveliais.
Merkiu leidžiamos sportinės-pažintinės kelionės visų tipų bemotoriais laivais. Šia upe dažnai plaukia turistai, mėgstantys nesudėtingus, be didelių gamtinių kliūčių maršrutus.
Ūla - viena iš vaizdingiausių ne tik Parko, bet ir Lietuvos upių, puikiai tinkanti vandens turizmui. Plaukimas ja gana sudėtingas: srauni tėkmė, posūkiai, daugybė išvirtusių medžių. Aukštupyje tekanti plačiomis salpinėmis pievomis, vidurupyje Ūla pereina į kanjonišką slėnį ir teka pro Gudų girioje pasislėpusius senuosius dzūkų kaimus. Abipus Ūlos upės tęsiasi kraštovaizdžio draustinis, todėl plaukimas šia upe ribojamas.
Vienos dienos Rudnia - Zervynos. Trukmė 5 val. Zervynos - Trakiškiai. Trukmė 6 val. Mančiagirė - Puvočiai. Trukmė 6 val.
Dviejų dienų Zervynos - Puvočiai. Trukmė 8 val. Rudnia - Puvočiai. Trukmė 13 val. Krokšlys - Trakiškiai. Trukmė 13 val.
Trijų dienų Krokšlys - Rudnia - Kašėtos - Pauosupė - Zervynos - Mančiagirė - Žiūrai - Trakiškiai - Paūliai -*(Mardasavas - Puvočiai - Merkinė)* * - Maršrutas veda Merkio upe.